یکی از گمرک های فعال و بسیار مهم در میان سایر گمرک های کشور گمرک بندر بوشهر می باشد. این گمرک به دلیل ویژگی های مختلفی که دارد باعث شده است تا، تاجران زیادی جهت ترخیص کالاهای خود و دریافت اجازه ورود آن ها به داخل کشور گمرک بندر بوشهر را انتخاب کنند. از جمله ویژگی هایی که باعث انتخاب گمرک بندر بوشهر توسط تاجران شده است می توان به مواردی چون وجود تخفیف های گوناگون در این بندر برای ترخیص کالا همچون تخفیف ۲۳ درصدی، سرعت بالای ترخیص کالا در این گمرک به دلیل فعالیت ۲۴ ساعته و تجهیزات تخلیه و بارگیری گوناگون، موقعیت جغرافیایی بسیار عالی این گمرک و مرز آبی آن با کشور های همسایه که باعث کاهش هزینه های حمل و نقل می شود، قیمت های مقرون به صرفه در خصوص خدمات گوناگون این گمرک همچون هزینه انبار، نیاز به تشریفات گمرکی حداقل و … اشاره کرد.